IBM超级计算机筛选出77种抗病毒化合物成抗疫新力量

在生死时速的抗疫竞赛中,速度越快越好。

在这场抗疫竞赛的背后,超级计算机成为了加速器。

截至3月3日24时,北京市累计确诊病例417例,治愈出院病例294例,死亡病例8例。现有疑似病例38例。累计确定密切接触者2796人,其中309人尚在隔离医学观察中。

据 Venture beat 报道,IBM 加入了由美国政府主导成立的 COVID-19 高性能计算联盟(High Performance Computing ,HPC),帮助研究人员部署预测模型,分析新冠疫情的发展过程,加速推进病毒治疗进程。

北京市最新召开的疫情防控工作会议指出,当前北京市疫情防控形势依然严峻复杂,特别是境外疫情持续蔓延,北京面临的境外输入风险骤然加剧。

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北京市有11个区已连续14天以上无新增确诊病例,具体为平谷区自有疫情以来无报告病例,延庆区40天、门头沟区39天、怀柔区26天、顺义区24天、东城区21天、密云区21天、石景山区19天、大兴区19天、房山区16天、昌平区15天无新增确诊病例。

亚马逊 AWS 部门启动一项计划,为研究机构和公司提供技术支持,推进 COVID-19 在诊断、治疗、疫苗等方面的研究。同样,微软也表示将通过扩展对 Azure 和高性能计算能力的访问,与科学家合作,为抗击 COVID-19 的研究人员提供所需工具。

伦斯勒理工学院将其人工智能多处理优化系统计算机(AiMOS)部署在伦斯勒计算创新中心,该学院表示正与研究机构接触,支持与 COVID-19 有关的研究。

会议指出,要通过首都严格进京管理联防联控协调机制,协同做好境外疫情输入的防范工作。加强远端管控,实行严密的入境检疫措施。来自或去过疫情严重国家、以北京为目的地的入境人员,到京后居家或集中观察14天。加强对外籍人员聚集区的防疫工作,做好在京外籍人员的健康监测管理,实现高风险人群不漏一人、不留死角。(完)

疫情发生以来,党中央把湖北和武汉作为疫情防控斗争的重中之重和决胜之地,采取一系列有效措施遏制疫情扩散势头。经过艰苦努力,湖北和武汉疫情防控形势发生积极向好变化,取得阶段性重要成果。同时也应清醒看到,湖北和武汉疫情防控任务依然艰巨繁重,疫情防控斗争进入关键阶段。气可鼓不可泄,劲可提不可松。越是这个时候,越要慎终如始,越要再接再厉、善作善成,继续把疫情防控作为当前头等大事和最重要的工作,毫不放松抓紧抓实抓细各项工作,不获全胜决不轻言成功。

3月3日0时至24时,北京市报告新增疑似病例11例、密切接触者61人。治愈出院患者6例。

民生稳,人心就稳,社会就稳。做好湖北和武汉的防控工作,必须“稳”字打底,通民情、问民需、顺民意,积极主动加大各方面工作力度,多做强信心、暖人心、聚民心的实事。疫情严重地方的群众自我隔离了较长时间,要多一些理解宽容包容,既有效疏导社会情绪,又充分考虑群众基本生活需求,保障米面粮油等生活必需品供应。对因疫情防控在家隔离的孤寡老人、困难儿童、残疾人等特殊群体,要加强走访探视,及时提供必要帮助;对患者及其家属、病亡者家属,要多一些人文关怀,加强心理疏导和心理干预。面对疫情防控中的问题和矛盾,关键是坚持依法防控,在法治轨道上统筹推进各项工作,切实维护社会大局稳定,为打赢湖北保卫战、武汉保卫战夯实社会基础。

目前,全球正处于抗击疫情的非常时期。数据显示,全球新冠病例确诊已超 33 万人(截至发稿),且海外多个国家正处疫情暴发期,确诊数量还在不断攀升。在这场抗疫竞赛中,时间是获胜的重要因素。对病毒的了解多一点,对疫苗的研究更近一步,新冠病毒的威胁就少一分。

“用药如用兵,用医如用将。”广大医务人员是战胜疫情的中坚力量,是新时代最可爱的人。战胜疫情,“白衣战士”的健康是重要保障。一线的医务工作者最辛苦,承受着难以想象的身体和心理压力。有关方面要切实改善医务人员的工作生活条件,落实好各项防护保障和激励措施,加强轮换和休整,尽最大努力确保一线医务人员健康和安全,千方百计帮助他们解除后顾之忧,使他们精神饱满、持续健康地投入抗疫斗争。

武汉胜则湖北胜,湖北胜则全国胜。在抗击新冠肺炎疫情的关键时刻,习近平总书记专门赴湖北省武汉市考察疫情防控工作,看望慰问奋战在一线的医务工作者、解放军指战员、社区工作者、公安干警、基层干部、下沉干部、志愿者和居民群众,对坚决打赢湖北保卫战、武汉保卫战进一步进行部署动员,极大地增强了全党全军全国各族人民战胜疫情的信心与力量。

确诊病例中,北京市16区中平谷区尚未有病例,东城区13例、西城区53例、朝阳区71例、海淀区63例、丰台区43例、石景山区14例、门头沟区3例、房山区16例、通州区19例、顺义区10例、昌平区29例、大兴区39例、怀柔区7例、密云区7例、延庆区1例,外地来京人员25例,境外输入人员4例。

打赢湖北保卫战、武汉保卫战,首要在“治”。生命重于泰山,人民群众的生命安全和身体健康最重要,必须把医疗救治工作摆在第一位,在科学精准救治上下功夫。要进一步落实“四集中”措施,集中优势医疗资源和技术力量救治患者,最大限度提高治愈率、降低病亡率。要加强统筹兼顾,既加快推广应用已经研发和筛选的有效药物,提升救治水平,又加强医疗防控物资生产、供应、调配;既要做好新冠肺炎患者救治工作,又要保障其他患者日常就医需求,逐步恢复正常医疗秩序。

打赢疫情防控阻击战,重点在“防”。现在正是疫情防控的关键时刻,决不能有丝毫松懈,必须咬紧牙关坚持下去。做好疫情防控工作,关键靠社区。要紧紧依靠人民群众,充分发动人民群众,做好深入细致的群众工作,加强社区防控措施的落实,构筑起群防群控的人民防线,进一步落实好内防扩散、外防输出的防控策略。在做好健康管理、落实防控措施的前提下,采取“点对点、一站式”等办法,集中精准输送务工人员安全返岗,帮助外地滞留在鄂人员安全有序返乡,为复工复产创造条件。

值得说明的是,尽管 Summit 计算能够在病毒研究方面发挥作用,但并不能够自行设计出一种治疗方法,其临床分析过程并不理想,还需医疗机构对已筛选出的化合物进行评估、测试才能用于临床试验。

确诊病例中,男性病例202例,占48.4%;女性病例215例,占51.6%。年龄范围为6个月至94岁,其中5岁以下14例,占3.4%;6岁至17岁13例,占3.1%;18岁至59岁279例,占66.9%;60岁及以上111例,占26.6%。

另外,Summit 辅助研究的方法仅是帮助缓解 COVID-19 的症状并提高存活率,而非疫苗研制。不过,在 COVID-19 高性能计算联盟中,除了 IBM,还包括了 Google、微软、美国能源部、伦斯勒理工学院等其他公司以及学术机构;而这些机构的计算能力同样在病毒研究中发挥着作用。

在此项研究中,研究人员从 8000 多种化合物入手,借助 Summit 的算法寻找可以与蛋白质结合并阻止病毒发挥作用的药物。

越来越多的力量加入了抗疫竞速之中,面对新冠病毒这一全人类的共同敌人,多方合力,抗疫成效终会呈现“1+1>2”。雷锋网雷锋网(公众号:雷锋网)

面对病毒(包括 COVID-19 病毒)这类新生化合物,研究人员会在实验室中培养微生物并观察其对引入的新生化合物的反应,逐渐缩小潜在变量的范围。不过,单独的变量可能包含着数百万甚至数十亿个数据需要模拟,仅依赖研究人员的观察,将是个巨大的挑战。

IBM 研究总监 Dario Gil 在博客中表示,在流行病学、生物信息学和分子建模的实验中需要大量计算,如果手动进行,实验需要数年才能完成;如果在速度较慢的传统计算平台上操作也需要数月的时间,而超级计算机高性能的计算系统能够快速解决这一计算问题。

初步结果显示,目前 Summit 已筛选出 77 种化合物能够与 Spike 蛋白结合,阻止病毒表面的份子与人类细胞上的血管紧张素转换酶2(angiotensin-converting enzyme 2,ACE2) 受体相连。

北京市卫生健康委员会4日表示,新增的3例确诊病例中,1例为伊朗输入病例、1例为意大利输入病例、1例为北京市本地病例,均已送至定点医疗机构进行救治。

在加入 COVID-19 高性能计算联盟之前,Summit 在新冠疫情研究中就已取得了突破。美国橡树岭国家实验室(Oak Ridge National Laboratory)研究人员表示其团队借助 Summit 寻找到可以对抗 COVID-19 的最有效的现有药物。